碳源，即含碳元素化合物，可為污（廢）水生化處理系統的微生物生長代謝提供營養物。其類型主要可以分為單一碳源和復合碳源。單一碳源是只含有一種有效碳源成分的碳源，而復合碳源則由兩種或兩種以上的有效碳源成分組成，這些成分之間需兼容且無化學反應，不存在安全風險。
市場上的碳源種類繁多，包括甲醇、醋酸、醋酸鈉、面粉、葡萄糖、生物質碳源、污泥水解上清液、啤酒廢水和垃圾滲濾液及復合型碳源等。這些碳源各具特點，如甲醇運行成本低、污泥產率低，但反應時間長、費用高，且有一定的毒害作用；乙酸鈉對脫氮過程反應迅速，但脫氮率低于甲醇，且價格高，會引發亞硝酸鹽積累；葡萄糖成本低，但需要配置溶液；生物質碳源成本低，性價比高，但穩定性需提高。復合型碳源是采用兩種或兩種以上有效碳源進行組合，其目的為綜合優勢，規避劣勢，使碳源發揮更大價值，提高污水脫氮除磷效果。
選擇哪種碳源主要取決于具體的應用場景和工程需求\成本、效果、安全性等，并根據實際情況進行選擇和調整。例如，在處理污水處理廠緊急投加碳源的情況時，可能需要考慮即時反應能力和效果；而在考慮成本效益時，可能更傾向于選擇價格較低且效果穩定的碳源。因此，最好的碳源應該是能夠滿足工程實際需求，且在成本、效果、安全性等方面都能達到平衡的碳源。而根據不同的工藝段需求，所需碳源也略有不同，例如濾池和生化脫氮工藝池所需碳源。